{"id":2190,"date":"2024-06-22T10:58:31","date_gmt":"2024-06-22T08:58:31","guid":{"rendered":"https:\/\/loamics.com\/e-health-how-data-control-is-helping-to-revolutionize-healthcare\/"},"modified":"2024-09-27T15:49:18","modified_gmt":"2024-09-27T13:49:18","slug":"e-sante-comment-la-maitrise-des-donnees-contribue-a-revolutionner-la-sante","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/loamics.com\/fr\/e-sante-comment-la-maitrise-des-donnees-contribue-a-revolutionner-la-sante\/","title":{"rendered":"E-sant\u00e9 : comment la ma\u00eetrise des donn\u00e9es contribue \u00e0 r\u00e9volutionner la sant\u00e9"},"content":{"rendered":"<p><span style=\"font-weight: 400;\">Dans un secteur de la <\/span><b>sant\u00e9<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> en pleine r\u00e9volution, la <\/span><b>ma\u00eetrise des donn\u00e9es<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> est devenue l\u2019enjeu central pour de nombreux acteurs.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">En effet, c\u2019est gr\u00e2ce au traitement de la donn\u00e9e que la m\u00e9decine a pu r\u00e9aliser ses avanc\u00e9es les plus spectaculaires au cours des derni\u00e8res d\u00e9cennies. Le premier s\u00e9quen\u00e7age d\u2019ADN humain ne date que de 1977. Il a fallu attendre 2003 pour que s\u2019ach\u00e8ve le premier projet de s\u00e9quen\u00e7age de g\u00e9nome humain.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">En 20 ans, la ma\u00eetrise des donn\u00e9es et les capacit\u00e9s de calcul ont largement explos\u00e9. Il y a quelques ann\u00e9es encore, le <\/span><b>s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome humain<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> \u00e9tait encore tr\u00e8s chronophage et tr\u00e8s co\u00fbteux. Les progr\u00e8s exponentiels de la bio-informatique permettent de changer d\u2019\u00e9chelle et ouvrent la porte \u00e0 l\u2019av\u00e8nement d\u2019une m\u00e9decine personnalis\u00e9e.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">A quels grands enjeux de sant\u00e9 la ma\u00eetrise de donn\u00e9es r\u00e9pond-elle\u00a0? Quels sont les d\u00e9fis auxquels les acteurs de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me font face et comment la solution Loamics contribue-t-elle \u00e0 les relever\u00a0?<\/span><\/p>\n<h2><span style=\"font-weight: 400;\">Le contexte\u00a0: d\u2019une m\u00e9decine standardis\u00e9e \u00e0 une m\u00e9decine personnalis\u00e9e<\/span><\/h2>\n<h3><span style=\"font-weight: 400;\">Une r\u00e9volution en marche<\/span><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Le secteur de la sant\u00e9 conna\u00eet en ce moment une v\u00e9ritable r\u00e9volution\u00a0: le <\/span><b>passage d\u2019une m\u00e9decine standardis\u00e9e \u00e0 une m\u00e9decine personnalis\u00e9e.<\/b><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Jusqu\u2019ici, la m\u00e9decine est largement standardis\u00e9e. Les patients qui pr\u00e9sentent une m\u00eame pathologie re\u00e7oivent tous le m\u00eame traitement. Ensuite, selon leur r\u00e9action au traitement, ils se scindent en 3 groupes\u00a0: <\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Le premier groupe r\u00e9agit positivement au traitement. La pathologie se r\u00e9sorbe.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Sur le deuxi\u00e8me groupe, le traitement est sans effet.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Enfin, pour le dernier groupe de patients, le traitement a des effets n\u00e9gatifs et l\u2019\u00e9tat de sant\u00e9 s\u2019aggrave.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Dans cette conception de la m\u00e9decine, on consid\u00e8re la pathologie mais sans prendre en compte l\u2019environnement au sein duquel elle se d\u00e9veloppe, c\u2019est-\u00e0-dire les caract\u00e9ristiques individuelles du patient.\u00a0<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">D\u00e9sormais, les progr\u00e8s r\u00e9alis\u00e9s dans le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome du patient permettent d\u2019identifier les g\u00e8nes qui pr\u00e9disposent \u00e0 une maladie, et m\u00eame d\u2019\u00e9tablir le profil g\u00e9n\u00e9tique de cellules canc\u00e9reuses. En formulant un diagnostic sur plusieurs biomarqueurs, on peut alors segmenter les patients en plusieurs groupes qui recevront chacun un traitement adapt\u00e9 \u00e0 leur diagnostic.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Puisque le traitement est adapt\u00e9 aux sp\u00e9cificit\u00e9s du patient, les chances de gu\u00e9rison sont plus importantes. C\u2019est ce qu\u2019on appelle la <\/span><b>m\u00e9decine personnalis\u00e9e<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">. Dans cette nouvelle logique, les m\u00e9decins ne traitent plus une pathologie mais contextualisent le traitement en fonction des donn\u00e9es multiples qu\u2019ils ont pu recueillir et analyser.<\/span><\/p>\n<h3><span style=\"font-weight: 400;\">Les donn\u00e9es au c\u0153ur de la m\u00e9decine personnalis\u00e9e<\/span><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La m\u00e9decine personnalis\u00e9e repose sur la capacit\u00e9 des acteurs de la e-sant\u00e9 \u00e0 <\/span><b>recueillir, centraliser, traiter et analyser des donn\u00e9es biologiques issues de sources diverses<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">. Dans cette optique, le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome et du m\u00e9tag\u00e9nome devient une discipline majeure.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">En effet, personnaliser les diagnostics et les traitements\u00a0n\u00e9cessite l\u2019int\u00e9gration de \u00ab\u00a0multi-omiques\u00a0\u00bb \u00e0 grande \u00e9chelle\u00a0:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">G\u00e9nomique<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Transcriptomique<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Prot\u00e9omique<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">M\u00e9tabolomique<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Outre le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome, la m\u00e9decine personnalis\u00e9e n\u00e9cessite de traiter des donn\u00e9es massives sur d\u2019autres variables de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me. La connaissance du syst\u00e8me microbiome est notamment cruciale car il impacte directement l\u2019efficacit\u00e9 du traitement.\u00a0<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Or, dans le corps humain, 10 puissance 16 bact\u00e9ries cohabitent pour cr\u00e9er un syst\u00e8me stable. Si on veut conna\u00eetre pr\u00e9cis\u00e9ment leurs composantes et leurs interactions, les volumes de donn\u00e9es sont immenses. Par cons\u00e9quent, les entreprises biotech ont besoin de capacit\u00e9s de calcul importantes.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La m\u00e9decine personnalis\u00e9e implique donc des techniques de s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 haut d\u00e9bit permettant une meilleure description de la diversit\u00e9 microbienne et des fonctions biologiques potentielles par l\u2019ensemble de la communaut\u00e9.<\/span><\/p>\n<h2><span style=\"font-weight: 400;\">E-sant\u00e9 et data\u00a0: quels enjeux pour les acteurs\u00a0?<\/span><\/h2>\n<h3><span style=\"font-weight: 400;\">L\u2019augmentation exponentielle des donn\u00e9es de sant\u00e9<\/span><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Le d\u00e9ploiement des nouvelles technologies, depuis les ann\u00e9es 2000, a entra\u00een\u00e9 une <\/span><b>hausse exponentielle du volume de donn\u00e9es de sant\u00e9<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">. A l\u2019\u00e9chelle globale, le volume total des donn\u00e9es d&rsquo;e-sant\u00e9 double tous les 73 jours\u00a0!<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Internet d\u2019abord, les r\u00e9seaux sociaux, le Cloud Computing ont facilit\u00e9 la g\u00e9n\u00e9ration et le partage d\u2019informations. Le d\u00e9veloppement des objets connect\u00e9s favorise la g\u00e9n\u00e9ration de donn\u00e9es de sant\u00e9 recueillies directement aupr\u00e8s de l\u2019utilisateur. Le d\u00e9ploiement de la 5G amplifiera encore cette massification des donn\u00e9es.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Les praticiens et les \u00e9tablissements de sant\u00e9 g\u00e9n\u00e8rent \u00e9galement de larges sets de donn\u00e9es : r\u00e9sultats patients, donn\u00e9es des essais cliniques, donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques, donn\u00e9es biocliniques, donn\u00e9es pathologiques, prescriptions de pharmacie, r\u00e9sultats de laboratoires\u2026<\/span><\/p>\n<h3><span style=\"font-weight: 400;\">Quels usages pour les donn\u00e9es de sant\u00e9 ?<\/span><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La <\/span><b>g\u00e9n\u00e9ration massive de donn\u00e9es de sant\u00e9<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> est une r\u00e9alit\u00e9.\u00a0<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">L\u2019un des enjeux de la e-sant\u00e9 est justement d\u2019acqu\u00e9rir une r\u00e9elle ma\u00eetrise de la donn\u00e9e pour en tirer des cas d\u2019usage b\u00e9n\u00e9fiques pour les m\u00e9decins et la population\u00a0:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Aide au diagnostic<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">M\u00e9decine personnalis\u00e9e<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Bases de connaissance partag\u00e9es<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Les parties prenantes int\u00e9ress\u00e9es par la e-sant\u00e9 sont donc multiples : m\u00e9decins et \u00e9tablissements de sant\u00e9, patients, collectivit\u00e9 (dans une logique de veille sanitaire et de politiques publiques de sant\u00e9), \u00e9tablissements de recherche, entreprises biotech\u2026<\/span><\/p>\n<h3><span style=\"font-weight: 400;\">Les challenges li\u00e9s aux donn\u00e9es<\/span><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La data ouvre des perspectives pour des cas d\u2019usage innovants en mati\u00e8re de sant\u00e9. Mais la masse de donn\u00e9es h\u00e9t\u00e9rog\u00e8nes \u00e0 g\u00e9rer soul\u00e8ve aussi de nouveaux d\u00e9fis\u00a0:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Le <\/span><b>stockage des donn\u00e9es<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0: collecter et centraliser des donn\u00e9es de sant\u00e9 \u00e0 grande \u00e9chelle requiert des capacit\u00e9s de stockage cons\u00e9quentes. Il faut \u00eatre en mesure de stocker et int\u00e9grer n\u2019importe quel type de donn\u00e9es n\u00e9cessaires.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><span style=\"font-weight: 400;\">Le <\/span><b>temps de calcul<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0: les donn\u00e9es recueillies sont h\u00e9t\u00e9rog\u00e8nes. En l\u2019\u00e9tat, elles ne peuvent pas imm\u00e9diatement \u00eatre exploit\u00e9es dans le cadre d\u2019une analyse. Le deuxi\u00e8me challenge consiste donc \u00e0 homog\u00e9n\u00e9iser les donn\u00e9es pour les rendre exploitables dans des cas d\u2019usage.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Par exemple, il y a encore quelques ann\u00e9es, le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome \u00e9tait tr\u00e8s chronophage et un s\u00e9quen\u00e7age se chiffrait en milliards d\u2019euros. Aujourd\u2019hui, on peut s\u00e9quencer 4 \u00e0 10 g\u00e9nomes en une journ\u00e9e pour un co\u00fbt unitaire avoisinant les 1000 \u20ac.\u00a0 Tout simplement parce que les outils existent pour <\/span><b>collecter les donn\u00e9es<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">, les <\/span><b>homog\u00e9n\u00e9iser<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">, <\/span><b>contr\u00f4ler leur qualit\u00e9<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> et <\/span><b>automatiser les workflows de machine learning et d\u2019intelligence artificielle.<\/b><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Une grande partie du travail de \u00ab\u00a0nettoyage\u00a0\u00bb de la donn\u00e9e dont le data scientist devait s\u2019acquitter est d\u00e9sormais automatis\u00e9. Il peut donc se concentrer sur des t\u00e2ches \u00e0 forte valeur ajout\u00e9e comme le d\u00e9veloppement de nouveaux algorithmes et l\u2019interpr\u00e9tation des donn\u00e9es.\u00a0<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La collecte, le contr\u00f4le de la qualit\u00e9 des donn\u00e9es, la standardisation et la normalisation de la data et les workflows deviennent des \u00ab t\u00e2ches d\u2019arri\u00e8re-plan \u00bb. Elles se font dans des d\u00e9lais beaucoup plus courts et \u00e0 moindre co\u00fbt. Les effets sont multiples : acc\u00e9l\u00e9rer la d\u00e9couverte et la description d\u2019une nouvelle pathologie ou encore acc\u00e9l\u00e9rer la mise sur la march\u00e9 d\u2019un nouveau traitement\u2026<\/span><\/p>\n<h2><span style=\"font-weight: 400;\">Comment la solution Loamics repond-elle aux d\u00e9fis des acteurs de la e-sant\u00e9 \u00a0?<\/span><\/h2>\n<h3><span style=\"font-weight: 400;\">Loamics, une solution horizontale pour une ma\u00eetrise optimale des donn\u00e9es <\/span><\/h3>\n<p><b>Loamics<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> est une <\/span><b>solution horizontale<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> qui accompagne les acteurs de sant\u00e9 dans leur volont\u00e9 de mieux ma\u00eetriser les donn\u00e9es en vue de d\u00e9velopper des applications-m\u00e9tiers data-based.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La solution s\u2019articule autour de <\/span><b>3 grandes briques<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0:<\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><b>Data Collect<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0: la solution collecte des donn\u00e9es massives et h\u00e9t\u00e9rog\u00e8nes, quels que soient le type de donn\u00e9es et leur source. Par exemple, pour les laboratoires qui travaillent sur la sant\u00e9, les donn\u00e9es peuvent \u00eatre des biomarqueurs, les donn\u00e9es du microbiote ou les donn\u00e9es de s\u00e9quen\u00e7age massif.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><b>Data Lake<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0: Loamics centralise les donn\u00e9es dans un m\u00eame entrep\u00f4t de donn\u00e9es, mais surtout la solution rend les donn\u00e9es exploitables. Elle homog\u00e9n\u00e9ise les donn\u00e9es pour les rendre utilisables dans les prises de d\u00e9cision ou dans le d\u00e9veloppement d\u2019applications m\u00e9tiers.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><b>Algorithms<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0: Loamics permet d\u2019automatiser facilement des sc\u00e9narios d\u2019algorithmes de machine learning ou d\u2019intelligence artificielle sur des donn\u00e9es pr\u00e9alablement nettoy\u00e9es et fiabilis\u00e9es.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Gr\u00e2ce \u00e0 ces 3 briques, la solution acc\u00e9l\u00e8re consid\u00e9rablement la transformation digitale du secteur biotech. Auparavant, le contr\u00f4le des donn\u00e9es et la validation des protocoles prenaient \u00e9norm\u00e9ment de temps. Cette partie est d\u00e9sormais automatis\u00e9e pour isoler rapidement un \u00e9chantillon de bonne qualit\u00e9.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">En d\u00e9finitive, Loamics r\u00e9pond au triple d\u00e9fi du stockage des donn\u00e9es, de l\u2019homog\u00e9n\u00e9isation et du temps de calcul.<\/span><\/p>\n<h3><span style=\"font-weight: 400;\">Une architecture data qui ouvre la voie \u00e0 des usages diversifi\u00e9s<\/span><\/h3>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Loamics lib\u00e8re les \u00e9quipes du travail sur le nettoyage de la donn\u00e9e et leur permet de se concentrer sur l\u2019interpr\u00e9tation des analyses et le design de nouvelles solutions.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Les cas d\u2019usage sont multiples\u00a0:\u00a0<\/span><\/p>\n<ul>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><b>Analyses personnalis\u00e9es<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> en partenariat avec des acteurs de l\u2019\u00e9cosyst\u00e8me\u00a0: la solution logicielle Loamics soutient l\u2019innovation, aboutissant au d\u00e9p\u00f4t de brevets combin\u00e9s, par exemple avec des entreprises biotech.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><b>Analyse des donn\u00e9es publiques existantes<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0: Loamics permet la mise en r\u00e9seau des donn\u00e9es de sant\u00e9 pour une meilleure collaboration internationale entre les acteurs. Nous d\u00e9veloppons une base de donn\u00e9es de sant\u00e9 en r\u00e9seau sous forme de DataMart.<\/span><\/li>\n<li style=\"font-weight: 400;\" aria-level=\"1\"><b>Aide au diagnostic<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> : l\u2019ouverture des donn\u00e9es m\u00e9dicales en France favorise la mise en r\u00e9seau des informations. Avec Loamics, il est possible d\u2019importer des donn\u00e9es textuelles issues des dossiers m\u00e9dicaux et de les traiter avec un algorithme IA pour extraire les r\u00e8gles m\u00e9dicales et faciliter le diagnostic par comparaison \u00e0 une ontologie.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">L\u2019explosion de la data est en passe de r\u00e9volutionner la m\u00e9decine. Mais, pour cela, encore faut-il que les professionnels du secteur gagnent en ma\u00eetrise des donn\u00e9es.\u00a0<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Stockage des donn\u00e9es, homog\u00e9n\u00e9isation, temps de calcul, la solution Loamics contribue aux innovations de sant\u00e9 en fournissant aux acteurs une architecture pour automatiser une partie du parcours de la donn\u00e9e et acc\u00e9l\u00e9rer le d\u00e9veloppement des applications m\u00e9tiers.<\/span><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p><a class=\"c-btn\" href=\"https:\/\/loamics.com\/fr\/e-sante-comment-la-maitrise-des-donnees-contribue-a-revolutionner-la-sante\/\">Contacter un expert<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Dans un secteur de la sant\u00e9 en pleine r\u00e9volution, la ma\u00eetrise des donn\u00e9es est devenue l\u2019enjeu central pour de nombreux acteurs. En effet, c\u2019est gr\u00e2ce au traitement de la donn\u00e9e que la m\u00e9decine a pu r\u00e9aliser ses avanc\u00e9es les plus spectaculaires au cours des derni\u00e8res d\u00e9cennies. 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